Sous la direction d’Agnès Callu
Yasuko Egawa (Ecole doctorale de l’Ecole des Chartes) : Processus créateur et pratique de travail de Jacques Gruber (1870-1936) : des dessins Art Nouveau-Art Déco
Sous la direction de Florence Descamps
Maelle Mériaux : Les archives orales en ethnobotanique de la Haute-Bretagne. Leur place dans la conservation et la valorisation des patrimoines. (En co-direction avec Ronan Le Coadic, professeur de sociologie, université de Rennes 2)
Philippe Masquelier : Gilbert Devaux, directeur à Rivoli (1949-1960) et l’ordonnance du 2 janvier 1959 : le songe budgétaire d’un « comptable ».
Sous la direction de Sabine Frommel
Charline Bessière : Romolo Ferrucci dit del Tadda : sculpteur animalier à Florence à la fin du XVIe siècle
Giulia Brusori : Les Émiliens en France, Fontainebleau en Émilie: dynamique d’un échange artistique au XVIe siècle.
En cotutelle avec l’Université de Bologne, sous la co-direction de Madame Sonia Cavicchioli et de Madame Sabine Frommel
Claudio Castelletti : Caryatides et autres figures de support à la Renaissance: art, architecture, archéologie
Apolline Couasse-Masson : Mauro Codussi et le classicisme architectural à Venise de 1460 à 1510 : mutation, assimilation des typologies et influences
Francesco Guidi : Giovanni Poggi (1493-1556). Biographie intellectuelle d’un cardinal à l’automne de la Renaissance. Co-tutelle avec l’Université de Roma 2 – Tor Vergata, sous la co-direction de Madame Maria Beltramini et Madame Sabine Frommel.
Wang Han : Les processus de transmission, de migration et d’assimilation de l’art de la Renaissance italienne dans la Chine du 20ème et du 21ème siècle
Maelyss Haddjeri : La science anatomique dans les arts graphiques du XVIe siècle. Étude de la circulation artistique dans l’aire méditerranéenne
Adela Klinerova : Architecture française de l’époque moderne dans le contexte de l’architecture du XIXe siècle dans les pays tchèques et en Europe centrale . Doctorat en cotutelle : Université Charles de Prague
Dominique Le Nen : Anatomie artistique pendant la Haute Renaissance, un regard sur trois destins croisés : Léonard de Vinci (1452 – 1519), Michel-Ange (1475 – 1564) et Raphaël (1483 – 1520).
Leonardo Lodi : Nouvelles visions architecturales dans l’Europe de la Renaissance: l’Italie et la France comme protagonistes.
Federico Manino : Architecture à l’antique dans le Marquisat de Saluces dans la première moitié du XVIe siècle
Melvin Mouton : Nicolo dell’Abate, maître de l’école de Fontainebleau (1552-1571). Formes et échanges.
Mercedes Moreno Partal
Evelin Páll : La critique de la représentation de la perspective monofocale dans la peinture baroque quadratura et la scénographie. Doctorat en cotutelle : ELTE, Budapest
Lucia Perez : De l’Italie à l’Espagne : migration et assimilation de l’architecture de la Renaissance italienne dans les œuvres de Pedro Machuca, Diego de Siloé et Andrés de Vandelvira.
Olimpia Ratto Vaquer : L’antique dans les dessins de Giuliano da Sangallo : re-lecture et re-analyse des reliefs et des représentations
Clément Savary : Le grand décor des bâtiments conventuels aux XVIIe et XVIIIe siècles
Michael Simonsen 
: L’approche holistique pour la planification de villas au XVIe siècle
Nicolas Trotin : La sculpture religieuse de la Renaissance en Normandie orientale.
Marina Viallon : Les tournois à la cour de France aux XVIe et XVIIe siècles
Tatiana Wegner : La prison dans les arts au XIXe siècle : Adoption et hybridation d’une image
Xiao Wu L’architecture des hôpitaux italiens du XVe siècle
Sous la direction de Pierre Gonneau :
Ion Dimitrov : Dumitru Staniloae et l’anthropologie théologique orthodoxe au XXe siècle
Kirill Kisselev : Le canoniste russe S.V. Troitski
Margarita Kostova : L’école de Tarnovo (XIVe-XVe s.), dépôt prévu sept. 2014
Panteleimon Pavlinciuc : La vie monastique en Moldavie pendant la période soviétique : l’exemple de Noul Neamt, dépôt prévu sept. 2014
Victor Smirnov : L’École de Volokolamsk dans la Russie moscovite
Alexeï Vlasov : Léon Zander (1893-1964) un témoin de l’orthodoxie en Occident
Sous la direction de Jean-Michel Leniaud
Guy Bertaud du Chazaud : La statuaire religieuse en Touraine de 1801 à 2000
Sébastien Chauffour : Jean-Jacques Huvé (1742-1808) : retour aux sources de l’architecture
Isabelle Conte : Le bal des Quat’Z’Arts
Anaïs Dupuy-Olivier : Jacques le Marquet, un artiste polyvalent. Sa pratique de scénographe de théâtre de 1953 à 1990
Gaël Favier : Biographie de Placide Poussielgue-Rusand
Eloise Fesli : Art nouveau à Istanbul, 1902 -1930
Anne-Sophie Isart : Charles Lameire (1832-1910) et les décors d’église
Camille Napolitano : Les cathédrales du commerce moderne : Grands Magasins et boutiques à l’Exposition internationale de 1925. L’architecture éphémère, théâtre d’une utopie
Jacques Patureau : L’Architecture d’une Chambre haute au XIXe siècle : le modèle français
Anne-Cécile Schreiner : La sociabilité de Jean-Jacques Henner.
Marie-Helene Wehr : Baptiste Petit-Gérard (1811-1871), peintre-verrier à Strasbourg, témoin et acteur de la renaissance du vitrail en Alsace au XIXe siècle
Sous la direction de François Queyrel :
Bilal Annan (co-direction de François Queyrel (EPHE) et François Villeneuve (Paris I) : Identités culturelles et représentation de soi au Proche-Orient hellénistique et romain : étude des monuments funéraires figurés.
Morgan Belzic : Les sculptures funéraires de Cyrénaïque (VIe siècle avant – IVe siècle après J -C.)
Antonia Kokkoliou : La nécropole de Hierai Pylai à Athènes et la topographie du secteur , thèse en co-tutelle avec Lorenz Baumer (professeur à l’Université de Genève), inscrite en 2009 ;
Rossella Pace : Les femmes en Sybaritide entre société indigène et cité achéenne. Statut, activités, représentations (IXe-VIe siècle avant J.-C.), thèse en co-tutelle avec Massimo Osanna (professeur à l’Université de la Basilicate), inscrite en 2009.
Sous la direction d’Isabelle Saint-Martin
Stéphanie Antona : Les thèmes religieux dans l’art vidéo des années 2000 à nos jours (perspective comparative France et Italie)
Pauline Carminati : La statuaire religieuse de série aux XIXe et XXe siècles. L’exemple de la maison Raffl (1796-1956)
Narae Kim : L’architecture des Missions Etrangère de Paris en Corée : Le Père Coste (1842-1897)
Christel Scheftsik Naujoks : La double réception juive et chrétienne de l’œuvre de Marc Chagall (1887-1985) après 1945
Josette Saint-Martin : Les chemins de croix des églises de Paris et sa région entre le XIXe et Vatican II
Anastasia Zalozina : La réception de l’icône dans la culture française du XXe siècle, son historiographie et sa place sur le marché de l’art actuel
Hui Zhao : La production du sens d’une œuvre ouverte: Jérusalem de William Blake
Sous la direction de Valentine Zuber :
Teoman Aydogan : La transformation du mouvement Gülen en France à la suite du « coup d’Etat » en Turquie (17/12/2013 et 15/7/2016).
Nabil Axeel Chekhman
Muharrem Ekinci : Du Kemalisme à l’« Erdoganisme» : laïcité et religion civile en Turquie.
Giuletta Faiella : L’injonction d’adaptation aux nouveaux temps : le discours savant sur le christianisme en France, en Italie et en Belgique à l’époque de l’élargissement démocratique (1965-2005).
Rita Grassi : Du dialogue interreligieux au dialogue interconvictionnel. Le cas de Raimon Panikkar.
Li Shuang : L’appui de la France aux missions étrangères en Chine, en dépit de la laïcisation de l’État : une entreprise de colonisation originale ?
Laurent Tessier : Foi et engagement politique. Protestantisme évangélique, conservatisme et politique étrangère au Canada.
Federica Torta : Sécularisation de la société et laïcisation de l’État macédonien : le défi du pluralisme balkanique.
Sevim Gulcan Uluhan : La piété religieuse : aide ou obstacle à la construction identitaire des immigrées musulmanes de Turquie.
YounKyung Choi : Laïcité, loi constitutionnelle et débats juridiques en France.